Если на компьютере установлена и Linux, MBR обычно заменяется кодом загрузчика GRUB. В таком случае GRUB может либо запустить Linux, либо совершить условный переход для запуска Windows. Альтернативный метод заключается в том, чтобы не трогать MBR и установить GRUB в загрузочном секторе системного раздела Linux, пометив этот раздел как «активный». Такой метод хотя и не противоречит правилам MBR, менее надежен и поэтому почти не используется. Основная загрузочная запись имеет размер всего 512 Мбайт, поэтому загрузчик не сможет полностью поместиться в MBR. Чтобы можно было обойти это ограничение, MBR может вместить ровно такой фрагмент кода, который позволит вам запустить оставшуюся часть загрузчика уже с жесткого диска. Соответственно, код GRUB подразделяется на две или три части: stagel находится в основной загрузочной записи и предназначена для того, чтобы загрузить первые сектора части stagel_5 или stage2. В части stagel_5 содержится дополнительный код, обеспечивающий доступ к файлам различных файловых систем. Наконец, в stage2 содержится сам загрузчик. Когда запустится загрузчик, появится меню, в котором будут на выбор представлены все операционные системы, определенные в процессе конфигурации GRUB (обычно это Windows и Linux). Теперь с помощью клавиш управления курсором можно выбрать интересующую вас операционную систему и запустить, нажав Enter. Часто GRUB настроен так, чтобы но истечении определенного промежутка времени операционная система загружалась автоматически.